Biologiczna rola sRNA OmrA

08 06 2023

Zapraszamy na seminarium instytutowe: w poniedziałek 12 czerwca o godz. 14 w sali 102B mgr Julia Konarska z Zakładu Mikrobiologii Molekularnej wygłosi seminarium pt. „Biologiczna rola sRNA OmrA i jego wpływ na poziom wirulencji i zdolności adaptacyjnych enteropatogenu Yersinia enterocolitica”.

Streszczenie:

Yersinia enterocolitica jest ważnym patogenem przewodu pokarmowego, który może powodować szereg chorób u ludzi. Bakteria ta jest heterogennym gatunkiem, o różnym stopniu zjadliwości, syntetyzującym szeroką gamę czynników wirulencji, takich jak adhezyny/inwazyny, wiele wydzielanych toksyn i białek efektorowych. Ich synteza jest ściśle regulowana w odpowiedzi na różne czynniki środowiskowe. Aby przystosować się do zmian warunków środowiskowych, bakterie regulują ekspresję genów na poziomie transkrypcji, ale także potranskrypcyjnie jak i potranslacyjnie. Znaczenie mechanizmów potranskrypcyjnych w regulacji ekspresji genów stało się przedmiotem zainteresowania stosunkowo niedawno, tj. z chwilą odkrycia małych, niekodujących cząsteczek RNA (sRNAs). Kodowane in trans sRNAs, czyli w miejscu innym niż regulowane geny, stanowią grupę małych regulatorowych RNA. Mają zazwyczaj długość 50-150 nukleotydów i modulują translację mRNA i/lub stabilność transkryptów poprzez parowanie zasad. Głównym celem naukowym projektu jest określenie celów działania OmrA w szczepach Y. enterocolitica o niskim (szczep Ye9N) i wysokim (szczep 8081) stopniu zjadliwości. Geny, których ekspresja będzie badana zostały wytypowane w wyniku przeprowadzonych analiz in silico. Informacje o zmianie w profilu ekspresji genów pod wpływem OmrA będą weryfikowane przy użyciu zarówno molekularnych jaki i fizykochemicznych analiz. Realizując projekt otrzymamy informacje o roli OmrA w potranskrypcyjnej regulacji ekspresji genów, co następnie pozwoli na ustalenie konsekwencji funkcjonalnych wynikających z aktywności OmrA i jego roli w kontroli strategii życiowej Y. enterocolitica związanej z patogenną oraz saprofityczną formą życia.