Ta strona wykorzystuje ciasteczka ("cookies") w celu zapewnienia maksymalnej wygody w korzystaniu z naszego serwisu. Czy wyrażasz na to zgodę?

Czytaj więcej

Zakład Genetyki Bakterii

ZespółTematyka badawczaProjektyPublikacjePatenty

Kierownik

prof. dr hab. Dariusz Bartosik
E-mail: d.bartosik@uw.edu.pl
Telefon: (22) 55 41318
Pokój: 319a/A

Zainteresowania: Zainteresowania: mikrobiologia, genetyka bakterii, biologia molekularna bakterii, regulacje ekspresji genów, ruchome elementy genetyczne, plazmidy, transpozony, struktura i ewolucja genomów bakteryjnych, antybiotykoporność, mechanizmy horyzontalnego transferu genów

Pracownicy

dr hab. Renata Godlewska
E-mail: r.godlewska@uw.edu.pl
Telefon: (22) 55 41321
Pokój: 321a/A

Zainteresowania: “mikrobiologia, genetyka bakterii, biologia molekularna bakterii, mechanizmy patogenezy bakteryjnej, bakteryjne pęcherzyki błonowe, bakterie patogenne związane z żywnością, antybiotykooporność”

dr hab. Anna Grudniak
E-mail: a.grudniak@uw.edu.pl
Telefon: (22) 55 41321
Pokój: 321a/A

Zainteresowania: biofilmy bakteryjne i grzybicze, mechanizm działania i skuteczność antybakteryjna nanocząstek, alternatywne terapie antybakteryjne, mikrobiom człowieka, biologiczne metody oceny skażenia środowiska

dr Magdalena Szuplewska
E-mail: m.szuplewska@uw.edu.pl
Telefon: (22) 55 41314
Pokój: 314/A

Zainteresowania: mikrobiologia, genetyka bakterii, biologia molekularna bakterii, ruchome elementy genetyczne, plazmidy, elementy transpozycyjne, horyzontalny transfer genów, patogeny oportunistyczne, mikrobiologia środowiskowa

dr Paweł Wawrzyniak 
E-mail: pwawrzyniak@uw.edu.pl
Telefon: (22) 55 41314
Pokój: 314/A

Zainteresowania: mikrobiologia, genetyka bakterii, biologia molekularna bakterii, ruchome elementy genetyczne, plazmidy, elementy transpozycyjne, horyzontalny transfer genów

dr hab. Agnieszka Wyszyńska
E-mail: ak.wyszynska@uw.edu.pl
Telefon: (22) 55 41341
Pokój: 341/A

Zainteresowania: mikrobiologia, genetyka bakterii, molekularne mechanizmy bakteryjnej patogenezy, bakterie chorobotwórcze układu pokarmowego, immunoprofilaktyka dla kurcząt, szczepionki, szczepy probiotyczne

dr Anna Łasica
E-mail: a.lasica@uw.edu.pl
Telefon: (22) 55 41341
Pokój: 341/A

Zainteresowania: mikrobiologia, genetyka bakterii, biologia molekularna bakterii, molekularne mechanizmy bakteryjnej patogenezy, patogeny układu pokarmowego, patogeny jamy ustnej, systemy sekrecji

Doktoranci

mgr Elvira Krakowska
E-mail: e.chapkauskaitse2@uw.edu.pl
Telefon: (22) 55 41344
Pokój: 324/A

Opiekun: prof. dr hab. Dariusz Bartosik
Zainteresowania: mikrobiologia, genetyka bakterii

mgr Rafał Jabłuszewski
E-mail: r.jabluszewski@uw.edu.pl
Telefon: (22) 55 41311
Pokój: 311/A

Opiekun: dr hab. Agnieszka Wyszyńska
Zainteresowania: mikrobiologia, genetyka bakterii, mobilom, genomika mikroorganizmów

mgr Kacper Karczmarzyk
E-mail: k.karczmarzy@student.uw.edu.pl
Telefon: (22) 55 41315
Pokój: 315/A

Opiekun: prof. dr hab. Dariusz Bartosik
Zainteresowania: mikrobiologia, genetyka bakterii

mgr Robert Lasek
E-mail: r.lasek@uw.edu.pl
Telefon: (22) 55 41311
Pokój: 311/A

Opiekun: prof. dr hab. Dariusz Bartosik
Zainteresowania: mikrobiologia, genetyka bakterii, mobilom, genomika mikroorganizmów, bakterie psychrofilne

mgr Zofia Owczarek
E-mail: z.owczarzak@uw.edu.pl
Telefon: (22) 55 41344
Pokój: 344/A

Opiekun: prof. dr hab. Dariusz Bartosik
Zainteresowania: mikrobiologia, genetyka bakterii, plazmidy, wakcynologia, epidemiologia

MOLEKULARNE PODSTAWY FUNKCJONOWANIA RUCHOMYCH ELEMENTÓW GENETYCZNYCH BAKTERII

Genomiczna i funkcjonalna charakterystyka plazmidów – mechanizmy replikacji, stabilnego dziedziczenia, transferu koniugacyjnego oraz analizy adaptacyjnych modułów genetycznych. Identyfikacja i analiza funkcjonalnych elementów transpozycyjnych. Określenie roli mobilomu oraz rekombinacji w determinowaniu zmienności i ewolucji bakterii. Praktyczne wykorzystanie ruchomych elementów genetycznych do konstrukcji narzędzi przydatnych w inżynierii genetycznej, biotechnologii i bioremediacji.

GENOMIKA MIKROORGANIZMÓW

Badanie struktury i funkcji genomów: (a) izolatów klinicznych i środowiskowych patogenów oportunistycznych, (b) wielolekoopronych szczepów bakterii patogennych, (c) bakterii z klasy Alphaproteobacteria (genomy złożone), oraz (d) bakterii psychrofilnych izolowanych z regionów polarnych.

ANALIZA MOLEKULARNYCH PODSTAW ZJAWISKA ANTYBIOTYKOOPORNOŚCI U BAKTERII

Identyfikacja i charakterystyka głównych nośników genetycznych oraz zdarzeń rekombinacyjnych determinujących fenotypy oporności. Mechanizmy transferu determinant antybiotykooporności. Rola egzogennych promotorów w aktywacji ekspresji genów oporności.

MOLEKULARNE PODSTAWY PATOGENEZY BAKTERYJNEJ

Badanie molekularnych podstaw patogenezy bakterii (na modelu Cronobacter spp, Campylobacter spp., Helicobacter pylori). Analiza oddziaływań patogenu z komórkami eukariotycznymi. Strukturalna i funkcjonalna analiza genów kodujących immunopozytywne białka z perspektywą wykorzystania do produkcji szczepionek.

Badanie mechanizmów wirulencji patogenów jamy ustnej związanych z próchnicą i chorobami przyzębia (ze szczególnym uwzględnieniem Porphyromonas gingivalis).

BIOLOGICZNE METODY ELIMINACJI BAKTERII PATOGENNYCH

Nanocząstki selenu i srebra pozyskane przy udziale klasycznych technik oraz w wyniku zielonej syntezy jako nowe narzędzie do walki z bakteriami. Określenie potencjału antybakteryjnego oraz zbadanie mechanizmu działania, nanocząstek selenu oraz nanocząstek srebra, ze szczególnym uwzględnieniem procesu usuwania biofilmów.

WYKORZYSTANIE BAKTERII W PROCESACH BIOREMEDIACJI GLEB

Detoksykacja zanieczyszczonych gleb może być wspomagana przez dodatek sideroforów lub mikroorganizmów produkujących te związki. Chociaż główną funkcją tych metabolitów jest chelatowanie żelaza w warunkach jego niedoboru, badamy również ich potencjał do mobilizacji jonów metali ciężkich w glebie. Badania prowadzimy na szczepach Pseudomonas izolowanych z kopalni miedzi.

WYKORZYSTANIE ZWIĄZKÓW POCHODZENIA NATURALNEGO DO ZWALCZANIA BAKTERYJNYCH I GRZYBICZYCH PATOGENÓW ŻYWNOŚCI

Naturalne związki (np. biosurfaktanty lub związki pochodzenia roślinnego) mogą stanowić alternatywę dla antybiotyków w walce z bakteriami i grzybami w żywności. Badamy działanie biosurfaktantów (surfaktyny i fengicyny produkowanych przez arktyczny szczep Bacillus subtilis) oraz związków izolowanych z porostów i  z roślin (z chmielu i rozmarynu) na bakteryjne patogeny żywności (Esherichia coli, Salmonella enterica, Campylobacter jejuni, Staphylococcus aureus, Listeria monocytogenes i Bacillus cereus) oraz grzyby z rodzajów Fusarium,  Botrytis.

W trakcie realizacji

Udomowianie mobilnego DNA – studium przypadku plazmidów wirulencji bakterii z rodzaju Cronobacter. Grant NCN – Opus (2018/29/B/NZ1/00140), realizowany w latach 2023-2026, kierownik projektu: prof. dr hab. D. Bartosik

Nowe spojrzenie na strukturę i funkcje systemów segregacji DNA plazmidów i chromosomów drugorzędowych typu repABC Alphaproteobacteria. Grant NCN – Preludium (UMO-2023/49/N/NZ2/01061), realizowany w latach 2024-2027, kierownik projektu: mgr E. Krakowska

Molekularny i fizjologiczny mechanizm odpowiedzi patogenów żywności na wybrane naturalne związki bioaktywne oraz opracowanie polimerów biodegradowalnych o aktywności antybakteryjnej. Grant NCN – OPUS (2019/35/B/NZ9/02774), realizowany w konsorcjum z Uniwersytetem Wrocławskim i Politechniką Wrocławską w latach 2020-2024, kierownik projektu: prof. dr hab. D. Misic

Zarządzanie mobilnością jonów metali ciężkich w środowisku – zastosowanie sideroforów produkowanych przez kopalniane szczepy Pseudomonas w remediacji zanieczyszczonych gruntów A. IDUB – Nowe Idee. Projekt realizowany w latach 2023-2024 we współpracy z Zakładem Geomikrobiologii i Zakładem Mikrobiologii Molekularnej – WB UW, kierownik projektu. dr hab. A. Wyszyńska

Mikrobiologiczne przemiany azotu w glebach arktycznych (Hornsund, Spitsbergen) jako źródło emisji podtlenku azotu – jednego z głównych gazów cieplarnianych. IDUB – Nowe Idee. Projekt realizowany w latach 2023-2024 we współpracy z Zakładem Geomikrobiologii WB UW i Zakładem Biologii Antarktyki IBB PAN. Kierownik projektu: dr hab. R. Matlakowska, prof. ucz.

Czy zielone znaczy lepsze? Porównanie właściwości antyoksydacyjnych, antybakteryjnych oraz mechanizmu działania nanocząstek selenu otrzymanych na drodze zielonej syntezy i konwencjonalną chemiczną metodą. IDUB – Nowe Idee. Projekt realizowany w latach 2023-2024 we współpracy z Środowiskowym Laboratorium Ciężkich Jonów UW, kierownik projektu: dr hab. A. Sentkowska

Badania mikrobiologiczne szczepów opornych na badany związek przeciwbakteryjny – analiza szczepów klinicznych. Projekt finansowany przez firmę ADAMED, kierownik projektu: dr hab. R. Godlewska

Zrealizowane

Tiolowe oksydoreduktazy bakterii rodzaju Helicobacter – biochemizna i strukturalna charakterystyka systemu Dsb Helicobacter hepaticus oraz planowanie i testowanie inhibitorów procesu oksydacyjnego zwijania białek Helicobacter pylori. Grant NCN – Opus (2018/29/B/NZ1/00140), realizowany w latach 2019- 2022, kierownik projektu: prof. dr hab. E.K. Jagusztyn-Krynicka / prof. dr hab. D. Bartosik

Oddychanie związkami arsenu i selenu u zróżnicowanych filogenetycznie bakterii – ku zrozumieniu genetycznych, biochemicznych i ewolucyjnych podstaw procesu. Grant NCN Opus (UMO-2017/26/D/NZ1/00408) realizowany w latach 2018-2021, kierownik projektu: dr L. Staicu

Genetycznie zmodyfikowane szczepy bakterii z klasy Alphaproteobacteria i ich wykorzystanie do stworzenia zoptymalizowanych układów do bioprodukcji barwników karotenoidowych. Grant NCN i NCBiR – Tango (TANGO2/339976/NCBR/2017), realizowany w latach 2017-2021; kierownik projektu: prof. dr hab. D. Bartosik

Określenie roli mobilnego DNA w kształtowaniu pangenomu bakterii z rodzaju Listeria (Firmicutes). Grant NCN – Opus (DEC-2016/21/B/NZ8/00383), realizowany w latach 2017-2021; kierownik projektu: prof. dr hab. D. Bartosik

Rola mobilomu w przejściu bakterii od saprofitycznego do patogennego trybu życia na przykładzie Paracoccus yeei. Grant NCN-Sonata (UMO-2016/21/D/NZ2/03824), realizowany w latach 2017-2021; kierownik projektu: dr M. Szuplewska

Mechanizmy regulacyjne dwóch pokrewnych systemów restrykcji-modyfikacji plazmidu pP62BP1 pochodzącego z arktycznego szczepu Psychrobacter sp. Grant NCN – Preludium (2015/17/N/NZ1/00227) realizowany w latach 2016-2020; kierownik projektu: mgr R. Lasek

Opracowanie wieloskładnikowej szczepionki podjednostkowej ograniczającej poziom kolonizacji jelit kurcząt przez pałeczki Campylobacter. Grant NCN – Opus (2016/21/B/NZ6/01141), realizowany w latach 2017-2019; kierownik projektu: dr A. Wyszyńska

2024
  1. Roszczenko-Jasińska P, Giełdoń A, Mazur D, Spodzieja M, Plichta M, Czaplewski C, Bal W, Jagusztyn-Krynicka EK, Bartosik D. 2024. Exploring the inhibitory potential of in silico-designed small peptides on Helicobacter pylori Hp0231 (DsbK), a periplasmic oxidoreductase involved in disulfide bond formation. Front Mol Biosci. 10:1335704.
  2. Sentkowska A, Konarska J, Szmytke J, Grudniak A. 2024. Herbal polyphenols as selenium reducers in the green synthesis of selenium nanoparticles: antibacterial and antioxidant capabilities of the obtained SeNPs. Molecules. 29(8):1686.
2023
  1. Bachurska-Szpala P, Burdach K, Lasek R, Tymecka D, Juhaniewicz-Dębińska J, Bartosik D, Pułka-Ziach K, Sęk S. 2023. De novo designed self-assembling helicomimetic lipooligoureas with antibacterial activity. Eur J Med Chem. 259:115700
  2. Barton LL, Duarte AG, Staicu LC. 2023. Genomic insight into iron acquisition by sulfate-reducing bacteria in microaerophilic environments. Biometals. 36(2):339-350.
  3. Decewicz P, Romaniuk K, Gorecki A, Radlinska M, Dabrowska M, Wyszynska A, Dziewit L. 2023 Structure and functions of a multireplicon genome of Antarctic Psychrobacter sp. ANT_H3: characterization of the genetic modules suitable for the construction of the plasmid-vectors for cold-active bacteria. J Appl Genet. 64:545–557.
  4. Kobierecka P, Wyszyńska A, Aleksandrzak-Piekarczyk T, Sałańska A, Gawor J, Bardowski J, Jagusztyn Krynicka KE. 2023. Genomic and transcriptomic analysis of Ligilactobacillus salivarius IBB3154-in search of new promoters for vaccine construction. Microbiol Spectr. 11(6):e0284423.
  5. Lasek R, Piszczek I, Krolikowski M, Sówka A, Bartosik D. 2023. A plasmid-borne gene cluster flanked by two restriction-modification systems enables an Arctic strain of Psychrobacter sp. to decompose SDS. Int. J. Mol. Sci. 25(1):551.
  6. Ruiz-Fresneda MA, Staicu LC, Lazuén-López G, Merroun ML. 2023. Allotropy of selenium nanoparticles: Colourful transition, synthesis, and biotechnological applications. Microb Biotechnol. 16(5):877-892.
2022
  1. Błażejewska A., M. Zalewska, A. Grudniak, M. Popowska. 2022. A Comprehensive Study of the Microbiome, Resistome, and Physical and Chemical Characteristics of Chicken Waste from Intensive Farms. Biomolecules 12 (8), 1132, 2022
  2. Czarnecki J. Chapkauskaitse E, Bos J, Sentkowska D, Wawrzyniak P, Wyszyńska A, Szuplewska M, Bartosik D. 2022. Differential localization and functional specialization of parS centromere-like sites in repABC replicons of Alphaproteobacteria. Appl Environ Microbiol. 88(8):e0020722.
  3. Jabłuszewski R, Wyszyńska A. 2022. Współczesne metody identyfikacji białkowych antygenów szczepionkowych. Adv Microbiol, 61, 4, 211–221.
  4. Lipszyc A, Szuplewska M, Bartosik D. 2022. How do transposable elements activate expression of transcriptionally silent antibiotic resistance genes? Int J Mol Sci. 23(15):8063.
  5. Morningstar-Wright, L; Czinn, SJ; Piazuelo, MB; Banerjee, A; Godlewska, R; Blanchard, TG 2022, The TNF-Alpha Inducing Protein is Associated With Gastric Inflammation and Hyperplasia in a Murine Model of Helicobacter pylori Infection. Front. Pharmacol. 13:817237.
  6. Narczyk M, Wojtyś MI, Leščić Ašler I, Žinić B, Luić M, Jagusztyn-Krynicka EK, Štefanić Z, Bzowska A.2022. Interactions of 2,6-substituted purines with purine nucleoside phosphorylase from Helicobacter pylori in solution and in the crystal, and the effects of these compounds on cell cultures of this bacterium. J Enzyme Inhib Med Chem. 37(1):1083-1097.
  7. Pyter W, Grewal J, Bartosik D, Drewniak L, Pranaw K. 2022. Pigment production by Paracoccus spp. strains through submerged fermentation of valorized lignocellulosic wastes. Fermentation. 8(9):440
  8. Staicu LC, Stolz JF. 2021. Editorial: microbes vs. metals: harvest and recycle. FEMS Microbiol Ecol. 97(5):fiab056.
  9. Staicu LC, Wójtowicz PJ, Molnár Z, Ruiz-Agudo E, Gallego JLR, Baragaño D, Pósfai M. 2022 Interplay between arsenic and selenium biomineralization in Shewanella sp. O23S. Environ Pollut. 306:119451.
2021
  1. Banaś AM, Bocian-Ostrzycka KM, Dunin-Horkawicz S, Ludwiczak J, Wilk P, Orlikowska M, Wyszyńska A, Dąbrowska M, Plichta M, Spodzieja M, Polańska MA, Malinowska A, Jagusztyn-Krynicka EK. 2021. Interplay between DsbA1, DsbA2 and C8J_1298 Periplasmic Oxidoreductases of Campylobacter jejuni and Their Impact on Bacterial Physiology and Pathogenesis. Int J Mol Sci. 22(24):13451.
  2. Burdach K, Tymecka D, Urban A, Lasek R, Bartosik D, Sek S. (2021). Interactions of linear analogues of battacin with negatively  charged lipid membranes. Membranes 11(3):192.
  3. Chmielowska C, Korsak D, Chapkauskaitse E, Decewicz P, Lasek R, Szuplewska M, Bartosik D. (2021). Plasmidome of Listeria spp. – the repA-family business. Int. J. Mol. Sci. 22:10320
  4. Chmielowska C, Korsak D, Szuplewska M, Grzelecka M, Maćkiw E, Stasiak M, Macion A, Skowron K, Bartosik D. (2021). Benzalkonium chloride and heavy metal resistance profiles of Listeria monocytogenes strains isolated from fish, fish products and food-producing factories in Poland. Food Microbiol. 98:103756.
  5. Izzo M, Osella S, Jacquet M, Kiliszek M, Harputlu E, Starkowska A, Łasica A, Unlu CG, Uśpieński T, Niewiadomski P, Bartosik D, Trzaskowski B, Ocakoglu K, Kargul j. (2021). Enhancement of direct electron transfer in graphene bioelectrodes containing novel cytochrome c553 variants with optimized heme orientation. J. Bioelectrochemistry. 140:107818.
  6. Macion A, Wyszyńska A, Godlewska R. 2021. Delivery of toxins and effectors by bacterial membrane vesicles. Toxins, 13:845.
  7. Madej M, Nowakowska Z, Ksiazek M, Lasica AM, Mizgalska D, Nowak M, Jacula A, Bzowska M, Scavenius C, Enghild JJ, Aduse-Opoku J, Curtis MA, Gomis-Rüth FX, Potempa J. 2021. PorZ, an essential component of the type IX secretion system of Porphyromonas gingivalis, delivers anionic lipopolysaccharide to the PorU sortase for transpeptidase processing of T9SS cargo proteins. mBio. 12(1):e02262-20.
  8. Nowak KP, Sobolewska-Ruta A, Jagiełło A, Bierczyńska-Krzysik A, Kierył P, Wawrzyniak P. 2021.  Molecular and functional characterization of MobK protein-a novel-type relaxase involved in mobilization for conjugational transfer of Klebsiella pneumoniae plasmid pIGRK. Int J Mol Sci. 22(10):5152.
  9. Pieńko T, Czarnecki J, Równicki M, Wojciechowska M, Wierzba AJ, Gryko D, Bartosik D, Trylska J. (2021). Vitamin B12-peptide nucleic acids use the BtuB receptor to pass through the Escherichia coli outer membrane. Biophys J. 120(4):725-737.
  10. Staicu LC, Barton LL. 2021. Selenium respiration in anaerobic bacteria: Does energy generation pay off? J Inorg Biochem. 222:111509.
  11. Staicu LC, van Hullebusch ED, Ackerson C. 2021. Editorial: Microbial Biominerals: Toward New Functions and Resource Recovery. Front Microbiol. 12:796374.
  12. Witkowska E, Łasica AM, Niciński K, Potempa J, Kamińska A. 2021. In search of spectroscopic signatures of periodontitis: A SERS-based magnetomicrofluidic sensor for detection of Porphyromonas gingivalis and Aggregatibacter actinomycetemcomitans. ACS Sens. 6(4):1621-1635.
  13. Wojtyś MI, Jaźwiec R, Kazazić S, Leščić Ašler I, Knežević P, Aleksić Sabo V, Luić M, Jagusztyn-Krynicka EK, Bzowska A. 2021. A comprehensive method for determining cellular uptake of purine nucleoside phosphorylase and adenylosuccinate synthetase inhibitors by H. pylori. Appl Microbiol Biotechnol. 105(20):7949-7967.
  14. Wyszyńska A, Godlewska R. 2021. Lactic acid bacteria – a promising tool for controlling chicken Campylobacter infection. Front Microbiol, 12:703441.
  15. Wyszyńska A, Jabłuszewski R. 2021. Glikozylacja białek w komórkach bakteryjnych i jej potencjalne zastosowania. Adv Microbiol, 60:137–149.
2020
  1. Banaś AM, Bocian-Ostrzycka KM, Plichta M, Dunin-Horkawicz S, Ludwiczak J, Płaczkiewicz J, Jagusztyn-Krynicka EK. 2020. C8J_1298, a bifunctional thiol oxidoreductase of Campylobacter jejuni, affects Dsb (disulfide bond) network functioning. PLoS One. 15(3):e0230366.
  2. Chmielowska C, Korsak D, Szmulkowska B, Krop A, Lipka K, Krupińska M, Bartosik D. (2020). Genetic carriers and genomic distribution of cadA6-a novel variant of a cadmium resistance determinant identified in Listeria spp. Int J Mol Sci. 21(22):8713.
  3. Hutcherson JA, Gogenini H, Lamont GJ, Miller DP, Nowakowska Z, Lasica AM, Liu C, Potempa J, Lamont RJ, Yoder-Himes D, Scott DA. 2020. Porphyromonas gingivalis genes conferring fitness in a tobacco-rich environment. Oral Microbiol. 35:10-18.
  4. Juhaniewicz-Dębińska J, Lasek R, Tymecka D, Burdach K, Bartosik D, Sęk S. (2020). Physicochemical and biological characterization of novel membrane-active cationic lipopeptides with antimicrobial properties. Langmuir. 36(43):12900-12910.
  5. Kawalek A, Wawrzyniak P, Bartosik AA, Jagura-Burdzy G. 2020. Rules and exceptions: the role of chromosomal ParB in DNA segregation and other cellular processes. Microorganisms. 8(1):0.
  6. Kisser J, Wirth M, De Gusseme B, Van Eekert M, Zeeman G, Schoenborn A, Vinnerås B, Finger DC, Kolbl Repinc S, Griessler Bulc T, Bani A, Pavlova D, Staicu LC, Atasoy M, Cetecioglu Z, Kokko M, Haznedaroglu BZ, Hansen J, Istenič D, Canga E, Malamis S, Camilleri-Fenech M, Beesley L. 2020. A review of nature-based solutions for resource recovery in cities. Blue-Green Systems. 2:138-172.
  7. Kulecka M, Fraczek B, Mikula M, Zeber-Lubecka N, Karczmarski J, Paziewska A, Ambrozkiewicz F, Jagusztyn-Krynicka K, Cieszczyk P, Ostrowski J. 2020. The composition and richness of the gut microbiota differentiate the top Polish endurance athletes from sedentary controls. Gut Microbes. 11(5):1374-1384.
  8. Maj A, Dziewit L, Drewniak L, Garstka M, Krucon T, Piatkowska K, Gieczewska K, Czarnecki J, Furmanczyk E, Lasek R, Baj J, Bartosik D. (2020). In vivo creation of plasmid pCRT01 and its use for the construction of carotenoid-producing Paracoccus spp. strains that grow efficiently on industrial wastes. 19(1):141.
  9. Roszczenko-Jasińska P, Wojtyś MI, Jagusztyn-Krynicka EK.2020. Helicobacter pylori treatment in the post-antibiotics era-searching for new drug targets. Appl Microbiol Biotechnol. 104(23):9891-9905.
  10. Równicki M, Lasek R, Trylska J, Bartosik D. (2020). Targeting type II toxin-antitoxin systems as antibacterial strategies. Toxins (Basel). 12(9):568.
  11. Staicu LC, Bajda T, Drewniak L, Charlet L. 2020. Power generation: feedstock for high-value sulfate minerals. Minerals 10:188.
  12. Staicu LC, Wojtowicz PJ, Pósfai M, Pekker P, Gorecki A, Jordan FL, Barton LL. 2020. PbS biomineralization using cysteine: Bacillus cereus and the sulfur rush. FEMS Microbiol Ecol. 96(9):fiaa151
2019
  1. Buczko Z, Osuchowska E, Olkowicz K, Tomassi P, Żółciak T, Błażejewska A, Grudniak AM. 2019. Wytwarzanie powłok kompozytowych z nanomateriałami węglowymi na różnych podłożach, badanie ich struktur oraz oddziaływań mikrobiologicznych. Inżynieria powierzchni 26:11-18.
  2. Ciok A, Cegielski A, Bartosik D, Dziewit L. 2019. Benefits and drawbacks of harboring plasmid pP32BP2, identified in Arctic psychrophilic bacterium Psychrobacter sp. Int. J. Mol. Sci. 20(8):pii.
  3. Czarnecki J, Bartosik D. 2019. Diversity of methylotrophy pathways in the genus Paracoccus (Alphaproteobacteria). Curr. Issues Mol. Biol. 33:117-132.
  4. Decewicz P, Dziewit L, Golec P, Kozlowska P, Bartosik D, Radlinska M. 2019. Characterization of the virome of Paracoccus spp. (Alphaproteobacteria) by combined in silico and in vivo approaches. Sci. Rep. 9:7899.
  5. Godlewska R, Klim J, Dębski J, Wyszyńska A, Łasica A. 2019. Influence of environmental and genetic factors on proteomic profiling of Outer Membrane Vesicles from Campylobacter jejuni. J. Microbiol. 68:255-261.
  6. Guevara T, Rodríguez-Banqueri A, Lasica AM, Ksiazek M, Potempa BA, Potempa J, Gomis-Rüth FX. 2019. Structural determinants of inhibition of Porphyromonas gingivalis gingipain K by KYT-36, a potent, selective, and bioavailable peptidase inhibitor. Rep. 9:4935.
  7. Korsak D, Chmielowska C, Szuplewska M, Bartosik D. 2019. Prevalence of plasmid-borne benzalkonium chloride resistance cassette bcrABC and cadmium resistance cadA genes in nonpathogenic Listeria spp. isolated from food and food-processing environments. J. Int. Food Microbiol. 290:247-253.
  8. Płaczkiewicz J, Adamczyk-Popławska M, Lasek R, Bącal P, Kwiatek A. 2019. Inactivation of genes encoding MutL and MutS proteins influences adhesion and biofilm formation by Neisseria gonorrhoeae. Microorganisms 7:pii:E647.
  9. Wawrzyniak P, Zaleski P, Sobolewska-Ruta A, Łukasiewicz N, Kabaj P, Kierył P, Gościk A, Bierczyńska-Krzysik A, Baran P, Mazurkiewicz-Pisarek A, Płucienniczak A, Bartosik D. (2019) Molecular dissection of the replication system of plasmid pIGRK encoding two in-frame Rep proteins with antagonistic functions. BMC Microbiology 19:254.
  10. Banaś AM, Bocian-Ostrzycka KM, Jagusztyn-Krynicka EK. 2019. Engineering of the Dsb (disulfide bond) proteins – contribution towards understanding their mechanism of action and their applications in biotechnology and medicine. Crit. Rev. Microbiol. 45:433-450.
  11. Wyszyńska A, Kobierecka P, Jagusztyn-Krynicka KE. 2019. Advancements in developing anti-Campylobacter vaccine for poultry. Mikrobiol. 58: 385-398.
2018
  1. Bubić A, Mrnjavac N, Stuparević I, Łyczek M, Wielgus-Kutrowska B, Bzowska A, Luić M, Leščić Ašler I. 2018. In the quest for new targets for pathogen eradication: the adenylosuccinate synthetase from the bacterium Helicobacter pylori. J. Enzyme Inhib. Med. Chem. 33:1405-1414.
  2. Ciok A, Budzik K, Zdanowski MK, Gawor J, Grzesiak J, Decewicz P, Gromadka R, Bartosik D, Dziewit L. 2018. Plasmids of psychrotolerant Polaromonas spp. isolated from arctic and antarctic glaciers – diversity and role in adaptation to polar environments. Microbiol. 9:1285.
  3. Grudniak AM, Klecha B, Wolska KI. 2018. Effects of null mutation of the heat-shock gene htpG on the producton of virulence factors by Pseudomonas aeruginosa. Future Microbiol. 13:69-80.
  4. Grzeszczuk MJ, Bocian-Ostrzycka KM, Banaś AM, Roszczenko-Jasinska P, Malinowska A, Stralova H, Haas R, Meyer TF. 2018. Thioloxidoreductase HP0231 of Helicobacter pylori impacts HopQ-dependent CagA translocation. J. Med. Microbiol. 308:977-985.
  5. Grzeszczuk MJ, Bąk A, Banaś AM, Urbanowicz P, Dunin-Horkawicz S, Gieldon A, Czaplewski C, Liwo A, Jagusztyn-Krynicka. 2018.Impact of selected amino acids of HP0377 (Helicobacter pylori thiol oxidoreductase) on its functioning as a CcmG (cytochrome c maturation) protein and Dsb (disulfide bond) isomerase.PLoS One. 13:e0195358.
  6. Jagielski T, Bakuła Z, Pleń M, Kamiński M, Nowakowska J, Bielecki J, Wolska KI, Grudniak AM. 2018. The activity of silver nanoparticles against microalgae of Prototeca genus. Nanomedicine 13:1025-1036.
  7. Lasek R, Szuplewska M, Mitura M, Decewicz P, Chmielowska C, Pawłot A, Sentkowska D, Czarnecki J, Bartosik D. 2018. Genome structure of the opportunistic pathogen Paracoccus yeei (Alphaproteobacteria) and identification of putative virulence factors. Microbiol. 9:2553.
  8. Markowska K, Grudniak AM, Milczarek B, Wolska KI. 2018. The effect of silver nanoparticles on Listeria monocytogenes PCM2191 peptidoglycan metabolism and cell permeability. J. Microbiol. 67:315-320.
  9. Romaniuk K, Ciok A, Decewicz P, Uhrynowski W, Budzik K, Nieckarz M, Pawłowska Zdanowski, J, Bartosik D, Dziewit Ł. 2018. Insight into heavy metal resistome of soil psychrotolerant bacteria originating from King George Island (Antarctica). Polar Biol. 41:1319.
  10. Równicki M, Pieńko T, Czarnecki J, Kolanowska M, Bartosik D and Trylska J. 2018. Artificial activation of Escherichia coli mazEF and hipBA toxin–antitoxin systems by antisense peptide nucleic acids as an antibacterial strategy. Front. Microbiol. 9:2870.
2017
  1. Czarnecki J, Dziewit L, Puzyna M, Prochwicz E, Tudek A, Wibberg D, Schlüter A, Pühler A, Bartosik D. 2017. Lifestyle-determining extrachromosomal replicon pAMV1 and its contribution to the carbon metabolism of the methylotrophic bacterium Paracoccus aminovorans JCM 7685. Microbiol. 19:4536-4550.
  2. Kobierecka P, Wyszyńska AK, Aleksandrzak-Piekarczyk T, Kuczkowski M, Tuzimek A, Piotrowska W, Górecki A, Adamska I, Wieliczko A, Bardowski J, Jagusztyn-Krynicka EK. 2017. In vitro characteristics of Lactobacillus spp. strains isolated from the chicken digestive tract and their role in the inhibition of Campylobacter colonization. MicrobiologyOpen 6:5, e00512.
  3. Lasek R, Dziewit L, Ciok A, Decewicz P, Romaniuk K, Jedrys Z, Wibberg D, Schlüter A, Pühler A, Bartosik D. 2017. Genome content, metabolic pathways and biotechnological potential of the psychrophilic Arctic bacterium Psychrobacter sp. DAB_AL43B, a source and a host of novel Psychrobacter-specific vectors. J. Biotechnol. 263:64-74.
  4. Prażmo EJ, Godlewska RA, Mielczarek AB. 2017. Effectiveness of repeated photodynamic therapy in the elimination of intracanal Enterococcus faecalis biofilm: an in vitro study. Lasers Med. Sci. 32:655-661.
  5. Równicki M, Wojciechowska M, Wierzba AJ, Czarnecki J, Bartosik D, Gryko D, Trylska. J. Vitamin B(12) as a carrier of peptide nucleic acid (PNA) into bacterial cells. Sci. Rep. 7:7644.
  6. Bocian-Ostrzycka KM, Grzeszczuk MJ, Banaś AM, Jagusztyn-Krynicka EK. 2017. Bacterial thiol oxidoreductases – from basic research to new antibacterial strategies. Appl. Microbiol. Biotechnol. 101:3977-3989.
  7. Lasica AM, Ksiazek M, Madej M, Potempa J. 2017. The type IX secretion system (T9SS): highlights and recent insights into its structure and function. 2017. Cell. Infect. Microbiol. 7:215.
  8. Jagusztyn-Krynicka EK, Grzeszczuk MJ, Kobierecka P. 2017. Nowe strategie walki z chorobami zakaźnymi – leki skierowane przeciwko czynnikom wirulencji. Kosmos 66:93- 107.
  9. Jagusztyn-Krynicka EK, Banaś AM, Grzeszczuk M. 2017. Strategie badania tiolowych oksydoreduktaz. Post. 56:326-334.
  10. Pawłowska M, Stańczak A, Pijarczyk Ł, Papka I, Czajka P, Hudemowicz P, Pięta M, Grudniak AM. 2018. Bezpieczeństwo i wykorzystanie nanocząstkowego srebra w zakażeniach o etiologii bakteryjnej. Zakażenia XXI wieku 1:291-294.
  11. Wawrzyniak P, Płucienniczak G, Bartosik D. 2017. The different faces of rolling-circle replication and its multifunctional initiator proteins. Front. Microbiol. 8:2353.

Patent nr P.407493: Bartosik D, Maj A, Dziewit L, Czarnecki J, Garstka M, Gieczewska K, Furmańczyk E, Baj J. „Plazmid będący pochodnym plazmidu pAMI2 z Paracoccus aminophilus JCM 7686 obejmujący funkcjonalne geny crt z Paracoccus marcusii OS22, zapewniające zdolność do wytwarzania karotenoidów i sekwencję przedstawioną na SEKW NR ID: 1, nowe szczepy bakteryjne, ich zastosowania, sposoby wytwarzania nowych szczepów bakteryjnych zdolnych do syntezy karotenoidów oraz sposoby wytwarzania karotenoidów”.

Patent nr P.431336 – wspólnie z Wydziałem Chemii UW. Sęk S, Tymecka D, Juhaniewicz-Dębińska J, Bartosik D, Lasek R. „Lipopeptydy, kompozycja farmaceutyczna, kompozycja kosmetyczna oraz lipopeptydy do zastosowania jako lek”

Międzynarodowe zgłoszenie patentowe nr PCT/IB2021/052911 – wspólnie z Wydziałem Chemii UW. Sęk S, Tymecka D, Juhaniewicz-Dębińska J, Bartosik D, Lasek R. „Lipopeptydy o działaniu przeciwbakteryjnym, kompozycja farmaceutyczna i kompozycja je zawierająca oraz zastosowanie”

Patent P.434296  o tytule: „Kompozycja bazowa środka bójczego”. Zgłaszający – „Nano-Tech Polska” Spółka z o.o. Sp. komandytowa, jednym z Twórców jest dr hab. Anna Grudniak, rezultat projektu POIR.02.03.02-14-0125/17