Pozakomórkowe DNA w rozprzestrzenianiu genów wirulencji i oporności
18 10 2023
Kategoria: Seminarium IM
W poniedziałek 13 listopada o godz. 14 w sali 102B mgr Anna Rokowska z Zakładu Mikrobiologii i Biotechnologii Środowiskowej wygłosi seminarium pt. „Rola pozakomórkowego DNA, powstającego podczas oczyszczania ścieków komunalnych, w rozprzestrzenianiu genów wirulencji i oporności na antybiotyki w ekosystemach wodnych”.
Streszczenie:
Problem narastającej antybiotykooporności nasila się ze względu na rozprzestrzenianie się genów oporności na antybiotyki (ARGs) i genów wirulencji (VGs) w różnych środowiskach, szczególnie w środowisku wodnym. Nasze badania skupiają się na komunalnych oczyszczalniach ścieków jako istotnych źródłach tych genów. Opierając się na wcześniejszych doniesieniach, zauważamy, że znaczna ilość pozakomórkowego DNA (exDNA) jest wytwarzana właśnie tam. ExDNA, pochodzący z lizujących komórek bakteryjnych, potencjalnie może być nośnikiem ARGs i VGs w szczególności tych powiązanych z mobilnymi elementami genetycznymi (MGEs), przyczyniając się tym samym do ich rozprzestrzeniania w ekosystemach wodnych.
Podczas mojego doktoratu przyjrzymy się losom exDNA pochodzącego z oczyszczalni ścieków w sztucznych mikrokosmosach wodnych, w tym w wodzie, osadach i mikrobiocie filtratorów. W tym celu wprowadzimy nowatorską metodę, integrującą mikroprzepływy kropelkowe z profilowaniem genomu pojedynczych bakterii w celu dokładnego prześledzenia i identyfikacji zdarzeń horyzontalnego transferu genów. Stosując takie synergistyczne podejście, zamierzamy określić rolę exDNA w propagacji ARGs, VGs i MGEs w ekosystemach wodnych.